האפיפיור פרנציסקוס נודע בצניעותו. כראש הכנסייה הקתולית, הוא לא קיבל משכורת כלל. על פי משרד העיתונות של הוותיקן, מדינת הכנסייה נשאה בכל הוצאות מחייתו וכן בכל ההוצאות הנדרשות למילוי תפקידו. ואולם, כשליט מוחלט של הוותיקן, פרנציסקוס יכול היה, באופן תיאורטי, להשתמש בכל רכוש הכנסייה.
פרנציסקוס, עוד מימי בחירתו, שם דגש על פשטות וצניעות כלכלית: הוא ויתר על הדירה האפיפיורית המסורתית בארמון האפיפיור, והתגורר בדירה פשוטה יותר בבית ההארחה "סנטה מרתה". גם בבחירת הרכב האישי שלו – מכוניות קטנות וצנועות – הדגיש שוב ושוב את רצונו להתרחק מחיי מותרות.
הוצאות מנהיג הכנסייה ממומנות גם באמצעות המוסד הבנקאי הפרטי של האפיפיור. מוסד זה, הקרוי "המכון לעבודות דתיות", הניב בשנת 2023 רווח של 30 מיליון אירו. סכום זה מיועד לאפיפיור, אשר העמיד אותו לרשות תקציב מנהל הוותיקן. בהיותו חבר במסדר הישועים, נאסר על פרנציסקוס באופן רשמי להרוויח כסף. חברי המסדר מתחייבים להעביר את הכנסותיהם לקהילה, בעוד הם עצמם מקבלים דמי כיס בלבד.
חלק מההכנסות שהאפיפיור מנהל מגיעות מה-"אובלוס הקדוש" (Obolo di San Pietro) – מנגנון תרומות ישיר של מאמינים מכל העולם, שנועד למימון פעילות הצדקה של האפיפיור ופעילות הדיפלומטיה של הוותיקן. בשנים האחרונות יש ירידה בתרומות האלה, גם בגלל פרשות שחיתות.
קרדינלים המכהנים בממשל המרכזי של הוותיקן (הקוריה הרומית) מקבלים, לפי ערוץ הטלוויזיה הקתולי EWTN, משכורת חודשית ברוטו של בין 5,000 ל-5,500 אירו. בשנת 2021, בעקבות משבר התקציב שנבע מהמגפה העולמית, הודיע האפיפיור פרנציסקוס על הפחתה של עשרה אחוזים בשכר הקרדינלים. צעד זה נועד לצמצם את הוצאות הוותיקן, כפי שדווח באתר "חדשות הוותיקן". הפחתה נוספת, גם היא בשיעור של עשרה אחוזים, הודיע פרנציסקוס בסוף אוקטובר 2024, כך דיווח העיתון האיטלקי "איל מסג'רו".
למרות המשכורת החודשית שנראית גבוהה, רבים מהקרדינלים מנהלים גם הוצאות שוטפות מהכיס האישי, בעיקר כשמדובר בנסיעות ופרויקטים של קידום הכנסייה במדינות שונות. זאת בנוסף לציפייה מהם לתרום חלק מהכנסתם למטרות צדקה.
אין בנמצא נתונים לגבי שכר הבישופים המשרתים במשרות הוותיקן. עם זאת, ידוע כי שכרם נקבע על פי התפקיד, הוותק במוסד וקטגוריית השכר. עובדי מנהל כדוגמת רואי חשבון, ארכיונאים ומומחי מחשוב משתכרים בין 1,500 ל-3,000 אירו ברוטו, כך מדווח העיתון האיטלקי "איל פאטו קוטידיאנו". על פי פולסאט ניוז, הכס הקדוש מקצה כ-140 מיליון אירו מדי שנה לשכר של כ-4,000 עובדים בסך הכול.